295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5378 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  74.76 
 
 		 518 aa  790    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  100 
 
 		 517 aa  1041    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  56.84 
 
 		 519 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  54.58 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  50.87 
 
 		 516 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  53.12 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  52.93 
 
 		 519 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  54.3 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  50.58 
 
 		 515 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  49.9 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  53.68 
 
 		 507 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  49.61 
 
 		 519 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  51.15 
 
 		 526 aa  505  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  51.75 
 
 		 517 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  44.51 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  44.98 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  41.54 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  47.29 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  45.54 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  47.12 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  41.12 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  41.47 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  41.12 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  47.58 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  42.51 
 
 		 999 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  39.41 
 
 		 983 aa  341  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 		 994 aa  334  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  32.49 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  33.23 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.38 
 
 		 570 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  29.28 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  26.92 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  28.8 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  27.92 
 
 		 560 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  30.48 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  31.82 
 
 		 436 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  29.33 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  30.97 
 
 		 701 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  29.81 
 
 		 556 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.93 
 
 		 658 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  25.79 
 
 		 564 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  30.97 
 
 		 668 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.21 
 
 		 681 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  30.41 
 
 		 680 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.38 
 
 		 684 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.83 
 
 		 692 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.91 
 
 		 690 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 		 643 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.39 
 
 		 681 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  25.52 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  29.28 
 
 		 642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.35 
 
 		 682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.38 
 
 		 658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 		 682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  25.96 
 
 		 708 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  29.19 
 
 		 645 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  23.33 
 
 		 710 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.24 
 
 		 715 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  26.46 
 
 		 559 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  28.7 
 
 		 671 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  31.44 
 
 		 667 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  27.03 
 
 		 550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  27.38 
 
 		 636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  28.4 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  29.33 
 
 		 638 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1163  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.99 
 
 		 711 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  28.87 
 
 		 553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  28.53 
 
 		 708 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  30.51 
 
 		 675 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  30.51 
 
 		 675 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  28.22 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.62 
 
 		 687 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.08 
 
 		 694 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2850  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 		 690 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  25.66 
 
 		 557 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.76 
 
 		 712 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.61 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  31.34 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.9 
 
 		 698 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.32 
 
 		 714 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 		 680 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  27.78 
 
 		 711 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  25.57 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.85 
 
 		 676 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29.27 
 
 		 686 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.45 
 
 		 726 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 		 687 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0135  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.49 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 		 690 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.64 
 
 		 693 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.75 
 
 		 684 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.74 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.07 
 
 		 694 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  27.74 
 
 		 687 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  28.95 
 
 		 735 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  26.53 
 
 		 641 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  27.23 
 
 		 681 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.5 
 
 		 765 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1204  hydantoinase/oxoprolinase  29.92 
 
 		 665 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  26.61 
 
 		 715 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>