277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1886 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
560 aa  1145    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  56.24 
 
 
556 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  52.22 
 
 
570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  52.09 
 
 
560 aa  548  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  42.16 
 
 
564 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  40.25 
 
 
559 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  37.27 
 
 
566 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  36.83 
 
 
579 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  36.58 
 
 
557 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  37.75 
 
 
559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  36.2 
 
 
583 aa  323  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  34.77 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  36.3 
 
 
572 aa  316  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  35.61 
 
 
550 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  35.55 
 
 
550 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  34.18 
 
 
557 aa  264  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  29.45 
 
 
546 aa  250  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.54 
 
 
693 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  28.03 
 
 
481 aa  170  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  35.03 
 
 
642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  35.19 
 
 
668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 
515 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  27.88 
 
 
516 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  34.52 
 
 
643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  27.45 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  28.12 
 
 
519 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  32 
 
 
658 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  28.16 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  32.32 
 
 
644 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  33.95 
 
 
667 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  31.63 
 
 
636 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  30.89 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  27.23 
 
 
518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  30.27 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  32.79 
 
 
522 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  30.92 
 
 
641 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  30.04 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  26.08 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  31.63 
 
 
701 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.93 
 
 
671 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  32.14 
 
 
522 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  30.73 
 
 
675 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  32.69 
 
 
639 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  28.71 
 
 
517 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 
675 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.35 
 
 
515 aa  123  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  33.97 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  25.96 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  26.54 
 
 
538 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  26.86 
 
 
507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  28.18 
 
 
516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  31.17 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  27.01 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.04 
 
 
682 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29.88 
 
 
686 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.23 
 
 
676 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  27.13 
 
 
983 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.4 
 
 
692 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  26.89 
 
 
523 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.56 
 
 
570 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.75 
 
 
676 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  29.07 
 
 
519 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  28.48 
 
 
517 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.36 
 
 
682 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  24.62 
 
 
706 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.87 
 
 
673 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  27.39 
 
 
665 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.36 
 
 
679 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.36 
 
 
684 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
994 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.6 
 
 
680 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.97 
 
 
690 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  23.4 
 
 
681 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.98 
 
 
575 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.34 
 
 
706 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.26 
 
 
684 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  27.74 
 
 
678 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.52 
 
 
765 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.89 
 
 
687 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.2 
 
 
687 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.57 
 
 
683 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  23.51 
 
 
708 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.33 
 
 
687 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
691 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  26.44 
 
 
707 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.35 
 
 
681 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  23.89 
 
 
513 aa  93.6  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  26.25 
 
 
999 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  23.88 
 
 
687 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.95 
 
 
681 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.12 
 
 
680 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  25.65 
 
 
679 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  24.95 
 
 
1355 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.69 
 
 
683 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.93 
 
 
657 aa  89.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.33 
 
 
699 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  24.95 
 
 
687 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  22.88 
 
 
676 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.7 
 
 
674 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.31 
 
 
680 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>