263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2177 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 665 aa  1296    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  46.43 
 
 		 575 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  53.77 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  41.6 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  32.93 
 
 		 667 aa  233  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  31.6 
 
 		 658 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.74 
 
 		 671 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.46 
 
 		 643 aa  217  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  31.18 
 
 		 668 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  33.48 
 
 		 675 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  33.68 
 
 		 675 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  31.08 
 
 		 642 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  30.36 
 
 		 638 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  29.46 
 
 		 701 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  27.26 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.65 
 
 		 639 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  27.3 
 
 		 645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  29.23 
 
 		 636 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  29.94 
 
 		 644 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  29.35 
 
 		 566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  31.55 
 
 		 550 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  27.38 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  26.33 
 
 		 572 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  30.2 
 
 		 522 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  30.05 
 
 		 522 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  28.11 
 
 		 560 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  29.34 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  29.39 
 
 		 707 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  28.9 
 
 		 515 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  30.32 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  27.23 
 
 		 538 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.11 
 
 		 676 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  26.33 
 
 		 556 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  27.76 
 
 		 516 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  29.09 
 
 		 735 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  28.39 
 
 		 518 aa  104  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.74 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  30.02 
 
 		 679 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.23 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.9 
 
 		 682 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.31 
 
 		 765 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.81 
 
 		 712 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  28.79 
 
 		 517 aa  98.2  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  29.68 
 
 		 693 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.89 
 
 		 692 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  31.06 
 
 		 583 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  27.03 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2850  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.03 
 
 		 690 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  27.46 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  28.5 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.73 
 
 		 706 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.9 
 
 		 681 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  29.6 
 
 		 734 aa  95.5  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.07 
 
 		 684 aa  95.1  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  25.71 
 
 		 519 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.56 
 
 		 682 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.71 
 
 		 684 aa  94  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.92 
 
 		 680 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.84 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.77 
 
 		 692 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  23.26 
 
 		 715 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  28.21 
 
 		 564 aa  92  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  30.12 
 
 		 708 aa  91.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.52 
 
 		 702 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.83 
 
 		 683 aa  91.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  26.33 
 
 		 523 aa  91.3  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  26.43 
 
 		 680 aa  91.3  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.38 
 
 		 680 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.06 
 
 		 660 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.85 
 
 		 690 aa  90.5  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.91 
 
 		 707 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  25.06 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  27.23 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  25.54 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.2 
 
 		 710 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  27.93 
 
 		 686 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  23.79 
 
 		 715 aa  88.2  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  30.24 
 
 		 560 aa  87.8  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  27.09 
 
 		 517 aa  87  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 		 712 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.59 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  25.32 
 
 		 999 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  27 
 
 		 710 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  29.27 
 
 		 694 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  23.98 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.41 
 
 		 711 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  24.04 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.61 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  25.96 
 
 		 673 aa  85.5  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.3 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.32 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.19 
 
 		 983 aa  85.1  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  28.37 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.37 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2507  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.71 
 
 		 708 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  22.37 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  25.48 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.71 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>