More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3269 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
667 aa  1316    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  50.67 
 
 
668 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  51.5 
 
 
675 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  51.35 
 
 
675 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  37.34 
 
 
658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  36.09 
 
 
671 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  35.46 
 
 
636 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  34.27 
 
 
644 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  33.28 
 
 
701 aa  316  9e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  35.43 
 
 
643 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  31.18 
 
 
639 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  31.88 
 
 
642 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  32.05 
 
 
641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  31.58 
 
 
645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  30.98 
 
 
638 aa  302  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  32.58 
 
 
553 aa  238  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  36.35 
 
 
570 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  33.9 
 
 
575 aa  211  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  35.08 
 
 
550 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  35.73 
 
 
566 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
557 aa  158  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  33.86 
 
 
665 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  35.94 
 
 
570 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  31.06 
 
 
557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  33.63 
 
 
572 aa  157  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  34.4 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  34.1 
 
 
579 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  32.61 
 
 
550 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  34.41 
 
 
583 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 
546 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  34.8 
 
 
519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  34.82 
 
 
707 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  26.17 
 
 
715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  34.59 
 
 
559 aa  144  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  35.35 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  30.55 
 
 
710 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  33.75 
 
 
516 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  31.99 
 
 
538 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  31.66 
 
 
708 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.2 
 
 
684 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  31.4 
 
 
523 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  32.85 
 
 
564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.76 
 
 
681 aa  137  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  30.23 
 
 
708 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.87 
 
 
681 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  33.95 
 
 
560 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  34.82 
 
 
516 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  32.92 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  31.94 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  35.09 
 
 
519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  32.16 
 
 
553 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  34.82 
 
 
735 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  31.32 
 
 
983 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  30.32 
 
 
715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  31.72 
 
 
513 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  34.41 
 
 
521 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
518 aa  126  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.26 
 
 
693 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  34.1 
 
 
522 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  33.24 
 
 
706 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.34 
 
 
682 aa  124  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  33.11 
 
 
522 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.65 
 
 
682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.14 
 
 
706 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  37.3 
 
 
519 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.48 
 
 
674 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.71 
 
 
690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  31.88 
 
 
734 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  31.44 
 
 
517 aa  118  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  31.47 
 
 
694 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.73 
 
 
676 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 
519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.03 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.55 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.77 
 
 
690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  29.78 
 
 
999 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  31.58 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 
994 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.25 
 
 
663 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  31.59 
 
 
517 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  31.91 
 
 
507 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.25 
 
 
674 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.05 
 
 
707 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.35 
 
 
726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  33.63 
 
 
526 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.56 
 
 
683 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.07 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.97 
 
 
692 aa  111  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.21 
 
 
680 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.96 
 
 
699 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  29.81 
 
 
463 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.4 
 
 
694 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  31.13 
 
 
559 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 
517 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 
678 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.08 
 
 
683 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 
662 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  29.81 
 
 
679 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.54 
 
 
765 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  29.06 
 
 
692 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>