More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2490 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  57.98 
 
 		 644 aa  759    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  58.03 
 
 		 671 aa  779    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  57.23 
 
 		 642 aa  740    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  100 
 
 		 636 aa  1296    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  59.53 
 
 		 701 aa  789    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  57.03 
 
 		 638 aa  727    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  58.11 
 
 		 643 aa  765    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  62.99 
 
 		 641 aa  825    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  55 
 
 		 645 aa  730    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  56.01 
 
 		 639 aa  737    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  35.06 
 
 		 658 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  35.46 
 
 		 667 aa  332  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.76 
 
 		 668 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  35.3 
 
 		 675 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  35.3 
 
 		 675 aa  293  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  31.77 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.88 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  31.39 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  36.81 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  33.52 
 
 		 550 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  35.56 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.14 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  32.84 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  32.52 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  32.52 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  28.11 
 
 		 665 aa  153  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  32.63 
 
 		 557 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  29.33 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  31.89 
 
 		 572 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  32.42 
 
 		 564 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  31.71 
 
 		 560 aa  140  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  30.36 
 
 		 556 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  30.06 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.78 
 
 		 680 aa  137  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  31.63 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  28.41 
 
 		 707 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.48 
 
 		 693 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  29.79 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  31.46 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.84 
 
 		 682 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.65 
 
 		 676 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  30.56 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  29.61 
 
 		 715 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  30.68 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  28.48 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 		 690 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  27.88 
 
 		 559 aa  120  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  28.45 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  30.5 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  29.74 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  31.56 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.42 
 
 		 687 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.32 
 
 		 657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  26.49 
 
 		 518 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 994 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  27.38 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 		 676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  28.4 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 		 523 aa  115  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  28.82 
 
 		 519 aa  114  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.65 
 
 		 706 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.93 
 
 		 687 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.84 
 
 		 687 aa  113  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.36 
 
 		 680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 		 684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.91 
 
 		 698 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.37 
 
 		 765 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.29 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  28.36 
 
 		 507 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  30.4 
 
 		 983 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  28.08 
 
 		 734 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  29.8 
 
 		 694 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 		 1206 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  29.13 
 
 		 522 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0135  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.4 
 
 		 699 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.37 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.78 
 
 		 682 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  28.07 
 
 		 693 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  28.71 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.79 
 
 		 683 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  27.89 
 
 		 689 aa  107  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.45 
 
 		 672 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  27.18 
 
 		 735 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  26.45 
 
 		 672 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.25 
 
 		 702 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.57 
 
 		 681 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24 
 
 		 711 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  26.91 
 
 		 526 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.07 
 
 		 683 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.16 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  26.63 
 
 		 679 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.89 
 
 		 694 aa  104  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 		 518 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  26.03 
 
 		 660 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 		 673 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.07 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.77 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.9 
 
 		 1225 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>