More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3384 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
735 aa  1396    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  65.6 
 
 
734 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  44.88 
 
 
715 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  47.52 
 
 
715 aa  560  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  40.34 
 
 
708 aa  535  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  38.81 
 
 
710 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  38.62 
 
 
708 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  42.63 
 
 
707 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  41.99 
 
 
694 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  33.43 
 
 
583 aa  132  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
679 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  34.82 
 
 
667 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.08 
 
 
692 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.25 
 
 
681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.73 
 
 
687 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.06 
 
 
682 aa  127  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  30.54 
 
 
553 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  31.42 
 
 
687 aa  127  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.62 
 
 
657 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.98 
 
 
681 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.39 
 
 
661 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.36 
 
 
726 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.4 
 
 
683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.19 
 
 
701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  27.49 
 
 
682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.51 
 
 
682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.4 
 
 
676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.16 
 
 
680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.1 
 
 
680 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.15 
 
 
662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  35.67 
 
 
668 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  30.66 
 
 
678 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  27.11 
 
 
566 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.33 
 
 
683 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  31.86 
 
 
550 aa  120  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4974  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.9 
 
 
679 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.05 
 
 
684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2850  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.45 
 
 
690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.54 
 
 
673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.4 
 
 
706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  28.25 
 
 
673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.96 
 
 
765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  27.71 
 
 
681 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.27 
 
 
739 aa  119  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  31.1 
 
 
643 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.17 
 
 
680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  29.88 
 
 
572 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.3 
 
 
691 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.65 
 
 
658 aa  117  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
684 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.95 
 
 
676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.9 
 
 
663 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.51 
 
 
674 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  27.51 
 
 
560 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.62 
 
 
706 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.51 
 
 
699 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  33.71 
 
 
675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.1 
 
 
674 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  32.07 
 
 
672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  33.71 
 
 
675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.94 
 
 
676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.55 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  30.51 
 
 
557 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2208  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.69 
 
 
688 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170446  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  31.7 
 
 
686 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  28.36 
 
 
516 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.82 
 
 
690 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.98 
 
 
673 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.52 
 
 
672 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  28.39 
 
 
515 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.8 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  27.91 
 
 
1355 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.89 
 
 
702 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.64 
 
 
694 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  28.29 
 
 
519 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.59 
 
 
691 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.49 
 
 
570 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  31.94 
 
 
550 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  31.93 
 
 
519 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  28.32 
 
 
645 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  28.01 
 
 
639 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.4 
 
 
707 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.94 
 
 
698 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.08 
 
 
690 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2942  5-oxoprolinase  30.97 
 
 
669 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  31.34 
 
 
660 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  29.39 
 
 
658 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 
690 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  31.49 
 
 
679 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.6 
 
 
678 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.46 
 
 
706 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  27.41 
 
 
538 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.89 
 
 
691 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  33.62 
 
 
564 aa  108  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.95 
 
 
692 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  29.44 
 
 
526 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.75 
 
 
684 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  28.28 
 
 
671 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  30.56 
 
 
701 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  31.74 
 
 
692 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>