298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1851 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  74.76 
 
 
517 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
518 aa  1028    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  56.84 
 
 
519 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  55.34 
 
 
517 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  51.36 
 
 
515 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  56.87 
 
 
507 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  54.97 
 
 
522 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  50.1 
 
 
516 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  50.39 
 
 
519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  48.74 
 
 
518 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  50.78 
 
 
519 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  51.85 
 
 
515 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  52.34 
 
 
517 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  50.1 
 
 
526 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  45.59 
 
 
538 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  42.12 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  48.16 
 
 
517 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  44.34 
 
 
516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  46.5 
 
 
519 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  41.67 
 
 
513 aa  395  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  41.2 
 
 
522 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  41.59 
 
 
522 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  48.34 
 
 
521 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  46.91 
 
 
519 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  42.59 
 
 
999 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  39.07 
 
 
983 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  39.57 
 
 
994 aa  333  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  34.64 
 
 
464 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  34.81 
 
 
463 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 
583 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  27.45 
 
 
566 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 
550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.52 
 
 
570 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  29.17 
 
 
564 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  30.46 
 
 
560 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  29.5 
 
 
639 aa  136  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.99 
 
 
643 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 
668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  30.79 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  26.71 
 
 
572 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  29.79 
 
 
671 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  32.47 
 
 
436 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  29.77 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  29.65 
 
 
550 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  32.47 
 
 
675 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  32.47 
 
 
675 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  27.59 
 
 
560 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
667 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  30.47 
 
 
644 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  31.86 
 
 
658 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  27.99 
 
 
557 aa  124  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  27.09 
 
 
708 aa  123  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  29.46 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.91 
 
 
701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  28.7 
 
 
638 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  25.05 
 
 
710 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  28.32 
 
 
645 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  26.49 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.8 
 
 
712 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.09 
 
 
714 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  29.21 
 
 
680 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  31.67 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  31.2 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  25.59 
 
 
708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.76 
 
 
682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  29.36 
 
 
715 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.54 
 
 
658 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  29 
 
 
579 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.66 
 
 
680 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.67 
 
 
684 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.26 
 
 
684 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  27.99 
 
 
715 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  27.84 
 
 
557 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  26.39 
 
 
641 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.79 
 
 
692 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
692 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.93 
 
 
690 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.84 
 
 
681 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.02 
 
 
765 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.75 
 
 
680 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  30.35 
 
 
735 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  27.71 
 
 
687 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.53 
 
 
575 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
688 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.85 
 
 
683 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.97 
 
 
690 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.42 
 
 
694 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.83 
 
 
681 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 
693 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  29.01 
 
 
693 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  29.31 
 
 
676 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  26.36 
 
 
553 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  27.78 
 
 
686 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  27.56 
 
 
559 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.36 
 
 
690 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  29.59 
 
 
678 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27 
 
 
676 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.65 
 
 
683 aa  97.4  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  23.71 
 
 
546 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  27.87 
 
 
693 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>