More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1404 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  58.91 
 
 
570 aa  669    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
560 aa  1126    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  52.09 
 
 
560 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  50.09 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  39.71 
 
 
559 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  40.72 
 
 
566 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  41.73 
 
 
564 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  40.54 
 
 
553 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  42.73 
 
 
583 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  40.11 
 
 
557 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  39.28 
 
 
579 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  40.22 
 
 
550 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  41.67 
 
 
550 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  36.92 
 
 
572 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  38.17 
 
 
559 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  38.02 
 
 
557 aa  339  8e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  29.93 
 
 
546 aa  258  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  33.85 
 
 
693 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  35.56 
 
 
639 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  28.88 
 
 
481 aa  170  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.81 
 
 
658 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  35.06 
 
 
643 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  30.13 
 
 
519 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  30.71 
 
 
515 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  34.4 
 
 
667 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  26.94 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  30.35 
 
 
519 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  31.68 
 
 
517 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  34.91 
 
 
644 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  30.08 
 
 
526 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  28.63 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
668 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  32.73 
 
 
701 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.59 
 
 
765 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.54 
 
 
684 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.87 
 
 
706 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  33.13 
 
 
638 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  28.31 
 
 
516 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.42 
 
 
671 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  31.71 
 
 
636 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  30.72 
 
 
645 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  27.15 
 
 
517 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  32.77 
 
 
675 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  29.18 
 
 
519 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  32.77 
 
 
675 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  30.46 
 
 
518 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.98 
 
 
676 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.85 
 
 
687 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  33.13 
 
 
642 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.84 
 
 
682 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.79 
 
 
682 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.13 
 
 
683 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  27.98 
 
 
707 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  32.54 
 
 
553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  31.01 
 
 
641 aa  134  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  29.75 
 
 
507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29.23 
 
 
686 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  26.62 
 
 
518 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  26.68 
 
 
983 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  25.73 
 
 
708 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.78 
 
 
570 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
680 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  29.83 
 
 
522 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.68 
 
 
674 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.92 
 
 
676 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.06 
 
 
673 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  27.26 
 
 
994 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  29.89 
 
 
519 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.45 
 
 
680 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  26.05 
 
 
523 aa  123  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  27.48 
 
 
679 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.7 
 
 
683 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
692 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.74 
 
 
694 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.06 
 
 
681 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.28 
 
 
684 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  29.28 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  26.48 
 
 
687 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  29.42 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.11 
 
 
711 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.65 
 
 
690 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  24.66 
 
 
710 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 
693 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  26.11 
 
 
680 aa  117  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.98 
 
 
681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  25.68 
 
 
676 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.94 
 
 
680 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  26 
 
 
673 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.05 
 
 
691 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  26.46 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  27.96 
 
 
665 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.5 
 
 
673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.82 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  24.21 
 
 
715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  28.81 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  27.86 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.97 
 
 
704 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.41 
 
 
679 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.21 
 
 
712 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.51 
 
 
694 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>