More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0141 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  100 
 
 
644 aa  1313    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  56.95 
 
 
671 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  58.11 
 
 
642 aa  775    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  57.98 
 
 
636 aa  759    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  56.09 
 
 
701 aa  734    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  58.24 
 
 
638 aa  790    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  54.62 
 
 
643 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  58.14 
 
 
641 aa  748    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  52.7 
 
 
645 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  57.39 
 
 
639 aa  760    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  36.73 
 
 
658 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  34.11 
 
 
667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  34.28 
 
 
668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  35.2 
 
 
675 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  35.73 
 
 
675 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  31.9 
 
 
553 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  31.16 
 
 
575 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.85 
 
 
570 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  37.2 
 
 
566 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  35.44 
 
 
579 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  34.33 
 
 
570 aa  157  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  34.91 
 
 
560 aa  153  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  33.43 
 
 
516 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  32.2 
 
 
583 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  32.12 
 
 
557 aa  150  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  31.31 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  31.49 
 
 
550 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.77 
 
 
550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  31.96 
 
 
519 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  34.35 
 
 
556 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 
515 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  32.12 
 
 
557 aa  138  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  32.32 
 
 
560 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  31.72 
 
 
559 aa  135  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  32.8 
 
 
518 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  28.53 
 
 
553 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  31.38 
 
 
517 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  28.69 
 
 
665 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  31.98 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  32.82 
 
 
564 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  30.47 
 
 
518 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  31.34 
 
 
507 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  30.97 
 
 
519 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.89 
 
 
681 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  28.83 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  30.47 
 
 
715 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  33.03 
 
 
519 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 
676 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.04 
 
 
681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  29.95 
 
 
693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  30.18 
 
 
519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  31.58 
 
 
559 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  31.55 
 
 
519 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  30.89 
 
 
660 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.62 
 
 
994 aa  117  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  28.4 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  32.94 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  29.44 
 
 
715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.81 
 
 
680 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
676 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  29.15 
 
 
523 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.17 
 
 
682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  28.73 
 
 
1362 aa  111  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  25.14 
 
 
680 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.2 
 
 
684 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.02 
 
 
690 aa  110  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.06 
 
 
687 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  30.03 
 
 
526 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.98 
 
 
684 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  28.17 
 
 
707 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  31.34 
 
 
983 aa  107  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  30.03 
 
 
522 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  29.23 
 
 
538 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  29.68 
 
 
522 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.14 
 
 
702 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  27.11 
 
 
1355 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.86 
 
 
706 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.2 
 
 
687 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.05 
 
 
682 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.49 
 
 
690 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  32.05 
 
 
521 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.75 
 
 
515 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.75 
 
 
707 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.22 
 
 
694 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.16 
 
 
687 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  28.33 
 
 
672 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  28.57 
 
 
692 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 
678 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  28.15 
 
 
708 aa  100  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 
714 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.06 
 
 
672 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 
674 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2942  5-oxoprolinase  30.38 
 
 
669 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.7 
 
 
692 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  27.89 
 
 
693 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.22 
 
 
698 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4389  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.61 
 
 
684 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  32.14 
 
 
734 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.43 
 
 
726 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>