More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2805 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  58.83 
 
 		 675 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  58.53 
 
 		 675 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 668 aa  1312    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  50.67 
 
 		 667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  36.23 
 
 		 658 aa  321  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  33.43 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  35.52 
 
 		 643 aa  316  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  34.28 
 
 		 644 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  33.96 
 
 		 671 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  32.16 
 
 		 641 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  32.62 
 
 		 645 aa  301  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.98 
 
 		 639 aa  299  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  31.85 
 
 		 638 aa  294  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  31.3 
 
 		 642 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  32.84 
 
 		 701 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  33.16 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  33.68 
 
 		 575 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  33 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  37.1 
 
 		 583 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  36.47 
 
 		 550 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  37.83 
 
 		 566 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  36.09 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  36.73 
 
 		 557 aa  163  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  34.5 
 
 		 570 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  32.47 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  33.53 
 
 		 579 aa  160  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  34.88 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  32.93 
 
 		 572 aa  154  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  33.01 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 		 715 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  32.23 
 
 		 665 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  35.88 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  35.19 
 
 		 560 aa  150  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  33.24 
 
 		 519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  34.21 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  33.63 
 
 		 560 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  31.8 
 
 		 538 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 		 515 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.74 
 
 		 684 aa  140  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  32.4 
 
 		 556 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  34.28 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  31.89 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  32 
 
 		 708 aa  138  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  32.85 
 
 		 707 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  34.21 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  30.5 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  30.3 
 
 		 513 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.49 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.34 
 
 		 682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  32.78 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 		 546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  31.4 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  34.19 
 
 		 521 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  33.72 
 
 		 564 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  30.2 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  34.3 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  33.96 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  30.97 
 
 		 517 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.71 
 
 		 681 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  33.13 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  35.67 
 
 		 735 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  31.66 
 
 		 517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.2 
 
 		 681 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  30.12 
 
 		 692 aa  120  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  34.78 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  33.85 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.46 
 
 		 765 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  32.12 
 
 		 734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  30.79 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.87 
 
 		 673 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  32.07 
 
 		 522 aa  117  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.65 
 
 		 682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  34.46 
 
 		 517 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  27.78 
 
 		 680 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.26 
 
 		 676 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  30.03 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.17 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  28.96 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  28.57 
 
 		 999 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.48 
 
 		 710 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.48 
 
 		 680 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.68 
 
 		 706 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.82 
 
 		 678 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  31.61 
 
 		 679 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.67 
 
 		 690 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.24 
 
 		 676 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.44 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.06 
 
 		 1215 aa  107  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  28.02 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.01 
 
 		 692 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.35 
 
 		 994 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 		 679 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4898  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.03 
 
 		 709 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.18 
 
 		 707 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.43 
 
 		 687 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.19 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0472  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.9 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.69 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>