293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0222 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
557 aa  1126    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  49.65 
 
 
583 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  50.09 
 
 
550 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  47.54 
 
 
550 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  45.16 
 
 
553 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  44.67 
 
 
557 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  39.68 
 
 
572 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  40.61 
 
 
566 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  38.02 
 
 
560 aa  350  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  36.31 
 
 
693 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  35.19 
 
 
579 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  36.36 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  33.27 
 
 
546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  33.93 
 
 
556 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  31.65 
 
 
559 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  34.18 
 
 
560 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  35.51 
 
 
564 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  34.07 
 
 
559 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  34.95 
 
 
643 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.62 
 
 
658 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  36.73 
 
 
668 aa  163  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  32.73 
 
 
638 aa  159  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  33.73 
 
 
642 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
667 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  34.15 
 
 
671 aa  158  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  32.62 
 
 
639 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  32.52 
 
 
636 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  31.04 
 
 
645 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  33.23 
 
 
701 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  32.12 
 
 
644 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  30.31 
 
 
517 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  31.1 
 
 
641 aa  144  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  31.12 
 
 
553 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  35.26 
 
 
675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  35.26 
 
 
675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  25.23 
 
 
710 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  27.79 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  29.04 
 
 
516 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  27.42 
 
 
481 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  26.95 
 
 
519 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.34 
 
 
570 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.19 
 
 
692 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  24.78 
 
 
715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  29.77 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  26.85 
 
 
707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  23.34 
 
 
708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  26.74 
 
 
518 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  30.48 
 
 
507 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  27.12 
 
 
538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  29.94 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  30.51 
 
 
735 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.51 
 
 
660 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.85 
 
 
690 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.32 
 
 
687 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 
657 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.46 
 
 
676 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  27.57 
 
 
519 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  27.46 
 
 
686 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  28.49 
 
 
517 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  27.2 
 
 
517 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  23.94 
 
 
523 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.99 
 
 
983 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  25.54 
 
 
515 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.18 
 
 
515 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 
652 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  26.08 
 
 
518 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.85 
 
 
676 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.18 
 
 
680 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25 
 
 
706 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2509  hydantoinase/oxoprolinase  25.86 
 
 
637 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212275  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  25.15 
 
 
516 aa  97.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.41 
 
 
691 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  27.3 
 
 
679 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.67 
 
 
643 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.28 
 
 
680 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  30.09 
 
 
734 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  27.16 
 
 
694 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.86 
 
 
692 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2208  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.5 
 
 
688 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170446  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  26.27 
 
 
715 aa  94.4  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  26.12 
 
 
708 aa  94.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.83 
 
 
683 aa  94  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.28 
 
 
651 aa  94  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.79 
 
 
680 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.46 
 
 
765 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  24.74 
 
 
673 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.85 
 
 
690 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  24.34 
 
 
681 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.93 
 
 
673 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.75 
 
 
714 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  27.27 
 
 
665 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.54 
 
 
690 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  27.82 
 
 
522 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.26 
 
 
673 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.75 
 
 
682 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.3 
 
 
690 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  26.3 
 
 
692 aa  90.1  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
672 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  26.75 
 
 
687 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.99 
 
 
687 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>