294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3607 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 675 aa  1286    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  58.92 
 
 		 668 aa  697    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  99.11 
 
 		 675 aa  1273    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  51.35 
 
 		 667 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  36.16 
 
 		 658 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  33.53 
 
 		 636 aa  329  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  32.22 
 
 		 642 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  32.62 
 
 		 643 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  35.73 
 
 		 644 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  32.78 
 
 		 645 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  34.97 
 
 		 671 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  32.42 
 
 		 638 aa  296  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  32.26 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  31.26 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  32.48 
 
 		 701 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  38.23 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  36.57 
 
 		 553 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  37.12 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  38.26 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  35.78 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  36.26 
 
 		 550 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  34.17 
 
 		 570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  33.86 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  35.49 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  33.69 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  31.47 
 
 		 538 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  31.7 
 
 		 715 aa  151  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  36.42 
 
 		 557 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  34.57 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  44.98 
 
 		 665 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  31.71 
 
 		 519 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  30.49 
 
 		 572 aa  144  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  31.03 
 
 		 708 aa  144  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.73 
 
 		 693 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.26 
 
 		 682 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  33.05 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  30.06 
 
 		 715 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  31.46 
 
 		 560 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.49 
 
 		 681 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.36 
 
 		 681 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  33.03 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  28.45 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  30.38 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  26.79 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.79 
 
 		 684 aa  134  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  29.97 
 
 		 708 aa  133  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  33.93 
 
 		 707 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  31.4 
 
 		 516 aa  132  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  31.82 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  32.34 
 
 		 564 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  34.74 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  32.09 
 
 		 556 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  29.46 
 
 		 680 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  32.14 
 
 		 517 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  32.13 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  34.01 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  33.52 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  31.09 
 
 		 983 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  33.82 
 
 		 516 aa  125  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  31.17 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  35.59 
 
 		 735 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.15 
 
 		 676 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  38.41 
 
 		 519 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  35.41 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.69 
 
 		 682 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  33.76 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  31.41 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 		 994 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  29.74 
 
 		 523 aa  117  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  30.56 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 		 731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  32.57 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  29.61 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  30.73 
 
 		 1362 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  34.56 
 
 		 519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  32.74 
 
 		 507 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 		 679 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.91 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.03 
 
 		 698 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 692 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.77 
 
 		 676 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.85 
 
 		 687 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  28.42 
 
 		 682 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.61 
 
 		 692 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  31.45 
 
 		 678 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.09 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  27.35 
 
 		 463 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  28.24 
 
 		 712 aa  107  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 		 683 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  27.34 
 
 		 711 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  31.89 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  31.56 
 
 		 686 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 		 684 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.08 
 
 		 710 aa  104  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  31.42 
 
 		 706 aa  104  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.2 
 
 		 726 aa  104  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.01 
 
 		 691 aa  104  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>