299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4112 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 538 aa  1102    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  45.59 
 
 		 518 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  46.08 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  45.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  45.35 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  46.8 
 
 		 522 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  45.05 
 
 		 519 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  44.32 
 
 		 517 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  43.95 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  44.51 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  45.75 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  43.22 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  42.28 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  42.61 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  43.16 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  44.34 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  42.66 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  43.38 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  42.94 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  43.93 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  38.52 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  37.74 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  37.12 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  38.92 
 
 		 519 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  37.22 
 
 		 999 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  35.37 
 
 		 983 aa  317  3e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  37.28 
 
 		 994 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  28.4 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  32.91 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  30.1 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  31.8 
 
 		 668 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  31.2 
 
 		 675 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  31.99 
 
 		 667 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  32.23 
 
 		 675 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 		 658 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  25.83 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.96 
 
 		 712 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  27.12 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 		 690 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.82 
 
 		 714 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.46 
 
 		 682 aa  117  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  25.87 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  28.41 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  28.81 
 
 		 559 aa  115  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  29.14 
 
 		 579 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.16 
 
 		 570 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.09 
 
 		 643 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.67 
 
 		 683 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  27.19 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  29.03 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  27.51 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  28.87 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.21 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.5 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  26.46 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.61 
 
 		 701 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  29.41 
 
 		 638 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.5 
 
 		 680 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 		 681 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.98 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  27.67 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  27.41 
 
 		 735 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  26.48 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.25 
 
 		 684 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  25.66 
 
 		 642 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  29.23 
 
 		 644 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.69 
 
 		 684 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  26.93 
 
 		 715 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  25.45 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.58 
 
 		 692 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.1 
 
 		 715 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  28.57 
 
 		 557 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  28.19 
 
 		 734 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.73 
 
 		 702 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  28.21 
 
 		 694 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  25.63 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  28.49 
 
 		 671 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  25.85 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.86 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28 
 
 		 690 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.24 
 
 		 692 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  23.99 
 
 		 583 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  26.23 
 
 		 678 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.81 
 
 		 682 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  27.65 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  25.25 
 
 		 550 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.83 
 
 		 690 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 		 685 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  27.02 
 
 		 641 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  27.59 
 
 		 698 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  27.87 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.75 
 
 		 680 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.89 
 
 		 697 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.32 
 
 		 658 aa  98.2  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  27.14 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 		 678 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>