More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1719 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  56.79 
 
 
692 aa  755    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
688 aa  1391    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.9 
 
 
680 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.39 
 
 
683 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.05 
 
 
711 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.34 
 
 
683 aa  524  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  45.1 
 
 
687 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.83 
 
 
694 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.66 
 
 
698 aa  475  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.38 
 
 
739 aa  469  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.96 
 
 
694 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.7 
 
 
701 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.75 
 
 
658 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.54 
 
 
680 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.26 
 
 
684 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.68 
 
 
676 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  38.57 
 
 
680 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.33 
 
 
680 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.32 
 
 
687 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.03 
 
 
765 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.32 
 
 
690 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.6 
 
 
712 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  38.93 
 
 
679 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.34 
 
 
692 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.26 
 
 
678 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  37.19 
 
 
681 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.19 
 
 
721 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.31 
 
 
662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.33 
 
 
648 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.97 
 
 
657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.47 
 
 
676 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.05 
 
 
691 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  37.68 
 
 
676 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.09 
 
 
661 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.03 
 
 
693 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.01 
 
 
676 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.02 
 
 
692 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  37.32 
 
 
694 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.54 
 
 
701 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.4 
 
 
674 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.4 
 
 
690 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2208  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.9 
 
 
688 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170446  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0132  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.16 
 
 
647 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367806  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.68 
 
 
672 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  38.04 
 
 
685 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  37.54 
 
 
672 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.2 
 
 
690 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.6 
 
 
707 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.42 
 
 
684 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.77 
 
 
673 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0466  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.45 
 
 
649 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.162226  hitchhiker  0.000000366174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.03 
 
 
690 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.75 
 
 
719 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.46 
 
 
680 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  35.16 
 
 
687 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.52 
 
 
687 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.54 
 
 
706 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.84 
 
 
691 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.55 
 
 
673 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  38.04 
 
 
1277 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  38.28 
 
 
698 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.43 
 
 
681 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  37.66 
 
 
682 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  36.3 
 
 
686 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.57 
 
 
687 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  38.21 
 
 
680 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.43 
 
 
682 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.99 
 
 
681 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.62 
 
 
682 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  37.06 
 
 
673 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.74 
 
 
690 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  37.31 
 
 
706 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.11 
 
 
697 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.36 
 
 
663 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.55 
 
 
704 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0425  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.47 
 
 
647 aa  372  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
684 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.82 
 
 
679 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.57 
 
 
674 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.88 
 
 
702 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.75 
 
 
641 aa  363  4e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.88 
 
 
690 aa  363  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4974  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.23 
 
 
679 aa  363  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.03 
 
 
699 aa  362  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.69 
 
 
707 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.77 
 
 
706 aa  360  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1935  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.77 
 
 
690 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.06 
 
 
711 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.11 
 
 
691 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0728  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
649 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.28 
 
 
652 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  34.97 
 
 
678 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.18 
 
 
657 aa  352  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.11 
 
 
693 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.56 
 
 
651 aa  349  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.59 
 
 
726 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  35.75 
 
 
660 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  38.17 
 
 
689 aa  343  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.52 
 
 
697 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  34.68 
 
 
692 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>