More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0092 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  100 
 
 
575 aa  1149    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  53.73 
 
 
570 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  47.21 
 
 
553 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  45.53 
 
 
665 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  32.35 
 
 
645 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  38.05 
 
 
675 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  33.45 
 
 
701 aa  246  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  38.23 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  30.9 
 
 
671 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  30.74 
 
 
643 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.61 
 
 
639 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.97 
 
 
658 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  31.16 
 
 
644 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  30.88 
 
 
636 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  31.15 
 
 
638 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.5 
 
 
668 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  29.77 
 
 
641 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  30.27 
 
 
642 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  33.9 
 
 
667 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  31.35 
 
 
519 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  30.56 
 
 
572 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.55 
 
 
692 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.17 
 
 
682 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.18 
 
 
680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.76 
 
 
682 aa  133  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  28.73 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.11 
 
 
691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  31.16 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  32.96 
 
 
660 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  32.27 
 
 
583 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  30.83 
 
 
692 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.97 
 
 
683 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.05 
 
 
673 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  29.71 
 
 
516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  29.26 
 
 
570 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  32.7 
 
 
686 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.09 
 
 
674 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.41 
 
 
681 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  30.55 
 
 
579 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  29.71 
 
 
522 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.65 
 
 
681 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.01 
 
 
680 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.56 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  29.7 
 
 
550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.97 
 
 
692 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.4 
 
 
701 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.64 
 
 
550 aa  122  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 
715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 
522 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
697 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.72 
 
 
684 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  31.71 
 
 
706 aa  120  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  28.89 
 
 
553 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.61 
 
 
676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.3 
 
 
680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  31.44 
 
 
679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.06 
 
 
678 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.93 
 
 
687 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.79 
 
 
685 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.08 
 
 
706 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.3 
 
 
680 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.79 
 
 
712 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.34 
 
 
679 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  29.67 
 
 
1362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.79 
 
 
698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  29.97 
 
 
1355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2850  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 
690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  30.77 
 
 
673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 
707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  30.79 
 
 
672 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  29.13 
 
 
681 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.93 
 
 
683 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 
690 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  29.02 
 
 
516 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.77 
 
 
687 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  28.7 
 
 
715 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  30.55 
 
 
735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.61 
 
 
673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  29.94 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  29.89 
 
 
687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.44 
 
 
765 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.91 
 
 
706 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.83 
 
 
690 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.42 
 
 
690 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.86 
 
 
707 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  28.81 
 
 
560 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  29.44 
 
 
694 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  26.09 
 
 
682 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.23 
 
 
706 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  28.29 
 
 
518 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.26 
 
 
714 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 
708 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.62 
 
 
711 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  26.82 
 
 
676 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.3 
 
 
663 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.59 
 
 
712 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.14 
 
 
684 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.56 
 
 
699 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>