More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0103 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
192 aa  360  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  75.53 
 
 
354 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  67.02 
 
 
272 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  67.2 
 
 
354 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  69.49 
 
 
354 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  66.92 
 
 
353 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  57.81 
 
 
387 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  58.54 
 
 
1094 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0105  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  59.12 
 
 
140 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  67.86 
 
 
154 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  49.07 
 
 
335 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  54.23 
 
 
819 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  59.52 
 
 
810 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  65.18 
 
 
689 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  58.06 
 
 
391 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  59.29 
 
 
366 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  60.47 
 
 
580 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.81 
 
 
1667 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.03 
 
 
415 aa  118  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.4 
 
 
752 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 
317 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  54.84 
 
 
332 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  48.39 
 
 
479 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  50.82 
 
 
556 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  47.2 
 
 
487 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.12 
 
 
383 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.45 
 
 
971 aa  104  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.84 
 
 
607 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  47.15 
 
 
1189 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.1 
 
 
347 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
776 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.67 
 
 
365 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.17 
 
 
312 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.64 
 
 
318 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.89 
 
 
314 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  56.56 
 
 
457 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.55 
 
 
348 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.18 
 
 
348 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  46.77 
 
 
366 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  52.42 
 
 
1170 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.44 
 
 
326 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  46.1 
 
 
306 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.41 
 
 
313 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.47 
 
 
451 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  49.61 
 
 
370 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.86 
 
 
348 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.53 
 
 
406 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.78 
 
 
314 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.37 
 
 
1056 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.7 
 
 
310 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  39.37 
 
 
314 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.73 
 
 
239 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  48.78 
 
 
457 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  45.53 
 
 
417 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.52 
 
 
328 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.2 
 
 
330 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
334 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.32 
 
 
320 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.84 
 
 
328 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.65 
 
 
324 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.52 
 
 
943 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.52 
 
 
311 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.2 
 
 
327 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.29 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  35.16 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.47 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.71 
 
 
821 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.66 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.29 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.2 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.9 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.58 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.7 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.29 
 
 
329 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.71 
 
 
517 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.4 
 
 
328 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.57 
 
 
328 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.86 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.67 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.14 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.71 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  35.77 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.95 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.64 
 
 
323 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  37.4 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  37.4 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
340 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
340 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.48 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
340 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
377 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.22 
 
 
332 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.09 
 
 
488 aa  77.8  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.79 
 
 
321 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.97 
 
 
325 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.71 
 
 
335 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.37 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.29 
 
 
974 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.04 
 
 
2114 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.95 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>