168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0105 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0105  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
140 aa  276  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  60.14 
 
 
272 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  55.24 
 
 
354 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  52.86 
 
 
354 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  55.47 
 
 
192 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  63.41 
 
 
354 aa  99.4  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  60.98 
 
 
353 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.7 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  43.64 
 
 
335 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  50.93 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  44.04 
 
 
1094 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  47.06 
 
 
1667 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  56.79 
 
 
810 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.95 
 
 
752 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.82 
 
 
689 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  51.22 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  48.51 
 
 
819 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.84 
 
 
366 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  48.84 
 
 
580 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  50.63 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  50 
 
 
391 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  48.1 
 
 
313 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
347 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.11 
 
 
971 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.24 
 
 
607 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.57 
 
 
320 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.61 
 
 
365 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  47.56 
 
 
479 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.67 
 
 
326 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  52.56 
 
 
556 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.67 
 
 
821 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  43.59 
 
 
487 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.59 
 
 
317 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  44.87 
 
 
1189 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  33.75 
 
 
334 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 
348 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.22 
 
 
311 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  46.43 
 
 
306 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.2 
 
 
330 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.78 
 
 
1170 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.77 
 
 
478 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.77 
 
 
478 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 
776 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.26 
 
 
383 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.67 
 
 
311 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.76 
 
 
348 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.63 
 
 
451 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.25 
 
 
312 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.79 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.53 
 
 
329 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  44.16 
 
 
457 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.76 
 
 
517 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.77 
 
 
377 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.44 
 
 
328 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  47.76 
 
 
239 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.84 
 
 
329 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.08 
 
 
340 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.08 
 
 
340 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.08 
 
 
340 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5399  hypothetical protein  43.37 
 
 
500 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.42 
 
 
318 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.97 
 
 
1056 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.51 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.83 
 
 
327 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.66 
 
 
325 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  49.12 
 
 
457 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.55 
 
 
328 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4699  hypothetical protein  38.89 
 
 
363 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
348 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.8 
 
 
479 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.72 
 
 
2114 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36 
 
 
366 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.1 
 
 
366 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  29.87 
 
 
325 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.9 
 
 
335 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  44.78 
 
 
330 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
329 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.24 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.06 
 
 
328 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.47 
 
 
492 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
329 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.06 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.39 
 
 
314 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35 
 
 
366 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.62 
 
 
362 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 
328 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
329 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3857  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.73 
 
 
491 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.337785  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0247  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35 
 
 
336 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4934  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.73 
 
 
491 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.91 
 
 
328 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.62 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.03 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1190  lipoprotein; surface antigen  26.85 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 
601 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3994  putative lipoprotein  28.7 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  normal  0.825803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.27 
 
 
943 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1350  putative lipoprotein  29.63 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>