202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0371 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  51.09 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  50.54 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  45.54 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  51.79 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  48.37 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  46.27 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  46.63 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  46.11 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  42.44 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  43.48 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  44.09 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  43.48 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  43.48 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  43.62 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  41.08 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.75 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  44.38 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  41.94 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  42.54 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  40.74 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  41.67 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  40 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  40.78 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  41.53 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.2 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.33 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  40.62 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  39.46 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  40.59 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  38.92 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  39.38 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  37.88 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  38.17 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  37.97 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  42.27 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.18 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.25 
 
 		 229 aa  95.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  39.05 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  36.55 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  36.55 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.81 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.81 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  32 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  37.37 
 
 		 216 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  36.36 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.07 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 583 aa  89.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  38.5 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  36.76 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  38.95 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  31.03 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  33.88 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.78 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  30.61 
 
 		 261 aa  81.3  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  32.07 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.88 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.71 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  30.33 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.65 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.65 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  26.6 
 
 		 312 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  26.06 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  32.69 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  25.64 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  31.13 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  30.13 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  27.22 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  27.22 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  27.22 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  31.85 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  26.58 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  23.49 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  22.6 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  28.14 
 
 		 313 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  31.21 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  25 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  31.41 
 
 		 335 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  27.13 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 343 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 318 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  28.93 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  25.43 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  25.43 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  25.43 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  25.48 
 
 		 314 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>