More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0494 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  56.27 
 
 		 629 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  54 
 
 		 633 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  54 
 
 		 632 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  55.42 
 
 		 633 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.85 
 
 		 611 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 626 aa  1259    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  54.25 
 
 		 633 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  54.32 
 
 		 632 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  52.17 
 
 		 630 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  55.26 
 
 		 633 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  54.52 
 
 		 623 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  54.99 
 
 		 641 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  54.19 
 
 		 648 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  52.94 
 
 		 635 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  54.04 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  53.48 
 
 		 611 aa  625  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  50.62 
 
 		 641 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  51.08 
 
 		 644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  52.58 
 
 		 625 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  53.07 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  49.45 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  50.24 
 
 		 621 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.43 
 
 		 615 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.08 
 
 		 616 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  49.76 
 
 		 619 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  45.77 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.9 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  47.71 
 
 		 661 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  46.77 
 
 		 681 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  47.39 
 
 		 661 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.57 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  47.93 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  46.62 
 
 		 681 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  48.3 
 
 		 652 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.96 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  46.91 
 
 		 598 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  48.27 
 
 		 647 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  47.95 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.8 
 
 		 661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  47.52 
 
 		 622 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  47.2 
 
 		 617 aa  505  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  48.18 
 
 		 620 aa  498  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  41.9 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  45.02 
 
 		 664 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  45.22 
 
 		 644 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  45.9 
 
 		 660 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  44.86 
 
 		 657 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  44.86 
 
 		 635 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  44.71 
 
 		 657 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  44.38 
 
 		 651 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  44.18 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  44.18 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  46.98 
 
 		 604 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.36 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  42.73 
 
 		 643 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  42.63 
 
 		 602 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  43.91 
 
 		 603 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  43.82 
 
 		 606 aa  442  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 612 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  43.02 
 
 		 594 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  42.39 
 
 		 605 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  41.55 
 
 		 626 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.56 
 
 		 600 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  44.37 
 
 		 632 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.81 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.59 
 
 		 644 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  44.3 
 
 		 603 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  43.24 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  41.95 
 
 		 632 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  42.37 
 
 		 621 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  42.66 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 		 620 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  42.45 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  42.14 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  42.23 
 
 		 661 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  40.16 
 
 		 617 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  38.27 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  42.61 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  42.3 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  41.39 
 
 		 595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  42.99 
 
 		 605 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  43.24 
 
 		 643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 608 aa  405  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  41.9 
 
 		 621 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  42.56 
 
 		 671 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  40.74 
 
 		 637 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 647 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  42.55 
 
 		 648 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  40.76 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  41.84 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  41.08 
 
 		 633 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 650 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  38.8 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 607 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 653 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  40.35 
 
 		 649 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>