More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0445 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  100 
 
 		 426 aa  825    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  63.85 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  36.07 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  36.62 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  36.52 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  35.02 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  34.54 
 
 		 481 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  33.41 
 
 		 466 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  31.25 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  28.73 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  31.53 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.59 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0060  amino acid transporter  32.61 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.490002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.41 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  31.23 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  27.91 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  28.04 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  28.27 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  28.27 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  28.27 
 
 		 510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.93 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.49 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.49 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.49 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.48 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  29.13 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.71 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.48 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.48 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.98 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.48 
 
 		 471 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  30.3 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  30.11 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  30.11 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  30.37 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  30.54 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  28.37 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.59 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.23 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  27.51 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.67 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.11 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  30.54 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  26.74 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  28.23 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  28.23 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  28.23 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  28.23 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  28.23 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  27.47 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.08 
 
 		 471 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.75 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  26.7 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  26.7 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  26.97 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  26.7 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  26.7 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  26.46 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  31.27 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  25.97 
 
 		 439 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  26.37 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  26.21 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>