More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11214 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
298 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.21 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  32.2 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.76 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  36.36 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  36.36 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  23.13 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  37.61 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  37.72 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  30.26 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
255 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 
462 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  31.47 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  25.43 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
324 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  31.29 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  36 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  25.71 
 
 
307 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  31.29 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  25.49 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.72 
 
 
562 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
349 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>