More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10135 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  38.01 
 
 
291 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 
294 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
324 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
300 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
275 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
288 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
288 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
283 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
301 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
287 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.44 
 
 
313 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
301 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
270 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
273 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
294 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
297 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 
283 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
323 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
294 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  31.51 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
294 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
284 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
341 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
308 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
308 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
274 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
308 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
293 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  36.14 
 
 
494 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
282 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
315 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
315 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
321 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
324 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
290 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
287 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
308 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
307 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
291 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
308 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.33 
 
 
293 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
312 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
289 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
315 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 
310 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
306 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
289 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
306 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 
304 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
291 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
291 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.3 
 
 
311 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.53 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  30.09 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
296 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  26.85 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.5 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  26.51 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  26.51 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  26.09 
 
 
311 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  26.93 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>