More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10057 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  100 
 
 
874 aa  1780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  80.15 
 
 
459 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  58.31 
 
 
903 aa  997    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  52.34 
 
 
844 aa  884    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  83.81 
 
 
464 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  85.26 
 
 
448 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  88.06 
 
 
460 aa  719    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  85.26 
 
 
464 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  80.41 
 
 
469 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  38.57 
 
 
879 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  47.91 
 
 
1118 aa  545  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  67.8 
 
 
454 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  68.73 
 
 
457 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  69.74 
 
 
452 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  67.28 
 
 
451 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  66.84 
 
 
461 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  66.84 
 
 
460 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  38.8 
 
 
945 aa  539  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  67.34 
 
 
452 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  65.12 
 
 
468 aa  535  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  68.57 
 
 
452 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  64.32 
 
 
453 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  65.15 
 
 
455 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  65.26 
 
 
460 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  65.06 
 
 
474 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  65.01 
 
 
461 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  64.96 
 
 
449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  62.6 
 
 
457 aa  515  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  63.36 
 
 
480 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  64.02 
 
 
462 aa  499  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  38.55 
 
 
1272 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  55.61 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 
1381 aa  436  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  54.31 
 
 
509 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  86.61 
 
 
782 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  86.61 
 
 
782 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  80.99 
 
 
879 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  84.38 
 
 
863 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.02 
 
 
445 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  44.99 
 
 
446 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  79.3 
 
 
749 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  46.51 
 
 
448 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  41.25 
 
 
610 aa  365  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  41.04 
 
 
610 aa  361  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  46.25 
 
 
440 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  47.41 
 
 
456 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.9 
 
 
449 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  40.51 
 
 
585 aa  351  4e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  45.99 
 
 
458 aa  351  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  44.13 
 
 
449 aa  350  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.46 
 
 
453 aa  350  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.61 
 
 
456 aa  350  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  46.13 
 
 
454 aa  349  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  42.82 
 
 
442 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.96 
 
 
444 aa  348  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  75.63 
 
 
772 aa  346  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
454 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
446 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
453 aa  341  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.28 
 
 
449 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
456 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.39 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
481 aa  336  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  37.58 
 
 
593 aa  336  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.3 
 
 
449 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  45.19 
 
 
456 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.3 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
453 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  42.59 
 
 
447 aa  332  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.08 
 
 
444 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  37.87 
 
 
602 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  41.85 
 
 
463 aa  331  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.16 
 
 
442 aa  328  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.11 
 
 
442 aa  328  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  69.87 
 
 
871 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.86 
 
 
459 aa  326  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  69.55 
 
 
832 aa  325  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.53 
 
 
444 aa  321  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
441 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.53 
 
 
439 aa  320  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.26 
 
 
445 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.73 
 
 
481 aa  317  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.03 
 
 
509 aa  317  6e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  41.65 
 
 
453 aa  317  6e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
471 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  41.75 
 
 
457 aa  314  4.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  45.08 
 
 
443 aa  313  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
476 aa  312  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  41.73 
 
 
508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  41.39 
 
 
451 aa  311  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  42.37 
 
 
450 aa  311  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  40 
 
 
529 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  44.21 
 
 
450 aa  310  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>