More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0767 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  82.01 
 
 		 390 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 390 aa  801    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  61.6 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  56.81 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 249 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  38.49 
 
 		 264 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 254 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 253 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  32.65 
 
 		 464 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 239 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  31.89 
 
 		 256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.93 
 
 		 239 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  31.76 
 
 		 177 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  31.18 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 183 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  41.24 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 135 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.7 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.7 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 115 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  28.23 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 146 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 173 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 245 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  26.39 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 124 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 123 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 169 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 129 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 136 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 121 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 163 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 259 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 145 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 144 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 120 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 113 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  26.42 
 
 		 129 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 117 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.85 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 122 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 293 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 279 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  26.42 
 
 		 129 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 135 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 135 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>