More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0260 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  80.41 
 
 
443 aa  750  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  79.36 
 
 
443 aa  740  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  79.95 
 
 
443 aa  745  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  87.68 
 
 
443 aa  782  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  80.18 
 
 
443 aa  749  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  79.82 
 
 
443 aa  741  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  78.05 
 
 
441 aa  724  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  80.18 
 
 
443 aa  746  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  914  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  80.28 
 
 
443 aa  745  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  76.98 
 
 
442 aa  723  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  79.59 
 
 
443 aa  741  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  79.82 
 
 
443 aa  742  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  84.42 
 
 
461 aa  798  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  87.13 
 
 
443 aa  817  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.13625e-07  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  80.64 
 
 
443 aa  754  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  59.45 
 
 
447 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  59.53 
 
 
440 aa  493  1e-138  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  40.69 
 
 
457 aa  303  4e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  40.2 
 
 
457 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  40.2 
 
 
441 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
428 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  34.88 
 
 
443 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  36.36 
 
 
876 aa  254  2e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  38.52 
 
 
431 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.16 
 
 
452 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 
493 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  34.64 
 
 
470 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.05 
 
 
453 aa  237  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  37.13 
 
 
411 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  34.45 
 
 
422 aa  232  8e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  37.59 
 
 
462 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.65 
 
 
453 aa  230  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  32.83 
 
 
528 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  36.21 
 
 
466 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  34.19 
 
 
477 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  38.53 
 
 
411 aa  226  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  34.19 
 
 
494 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  35.49 
 
 
439 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  34.49 
 
 
501 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
954 aa  223  5e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  33.26 
 
 
539 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  33.9 
 
 
504 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  34.79 
 
 
482 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  36.52 
 
 
464 aa  221  2e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.02 
 
 
506 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  35.08 
 
 
413 aa  221  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  36.14 
 
 
411 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  33.98 
 
 
424 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  33.57 
 
 
514 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  34.16 
 
 
413 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  36.05 
 
 
414 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  32.33 
 
 
453 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  34.42 
 
 
492 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  34.77 
 
 
921 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  31.89 
 
 
532 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  33.01 
 
 
458 aa  216  6e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 
458 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  32.6 
 
 
458 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.94 
 
 
463 aa  215  1e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  35.58 
 
 
459 aa  215  1e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.09 
 
 
441 aa  215  1e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.26 
 
 
465 aa  215  1e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  32.75 
 
 
518 aa  215  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  32.85 
 
 
441 aa  214  2e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  31.97 
 
 
526 aa  214  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  31.93 
 
 
461 aa  214  3e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
456 aa  214  3e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  32.79 
 
 
465 aa  213  4e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.85 
 
 
455 aa  213  4e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  32.79 
 
 
465 aa  213  4e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  30.28 
 
 
440 aa  213  5e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  32.51 
 
 
470 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  32.2 
 
 
416 aa  213  8e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  32.2 
 
 
416 aa  213  8e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  29.04 
 
 
440 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  31.68 
 
 
513 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.75 
 
 
520 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  32.2 
 
 
945 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.81 
 
 
453 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  33.89 
 
 
434 aa  210  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  31.77 
 
 
550 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  31.94 
 
 
416 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  32.62 
 
 
943 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  33.66 
 
 
448 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  31.68 
 
 
949 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  32.68 
 
 
414 aa  207  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  32.92 
 
 
974 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  32.67 
 
 
945 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
484 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 
469 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  31.72 
 
 
415 aa  207  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  31.28 
 
 
468 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.44 
 
 
413 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  31.83 
 
 
461 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  32.13 
 
 
929 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  35.61 
 
 
459 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  32.13 
 
 
949 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.83 
 
 
476 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  30.71 
 
 
526 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>