More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1144 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 
590 aa  1228    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
608 aa  346  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 
608 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.36 
 
 
608 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 
630 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.21 
 
 
600 aa  334  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 
622 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.07 
 
 
609 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.5 
 
 
598 aa  329  8e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 
612 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.96 
 
 
605 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 
596 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.58 
 
 
621 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.48 
 
 
592 aa  299  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.67 
 
 
593 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 
592 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 
592 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 
592 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.81 
 
 
610 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.46 
 
 
610 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 
597 aa  286  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 
601 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
603 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
592 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 
600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
598 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  28.23 
 
 
723 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  28.12 
 
 
710 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  25.43 
 
 
639 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  24.56 
 
 
653 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.09 
 
 
534 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.09 
 
 
534 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 
708 aa  158  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 
572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
512 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.13 
 
 
545 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 
552 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 
536 aa  137  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 
551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  25.15 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  25.15 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  28.5 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  27.53 
 
 
501 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.83 
 
 
538 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 
539 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  22.6 
 
 
522 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.6 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  22.99 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.41 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.99 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.62 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.62 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 
549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 
503 aa  118  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.62 
 
 
517 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 
518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.7 
 
 
510 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.46 
 
 
510 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.7 
 
 
510 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.7 
 
 
510 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  26.04 
 
 
502 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.97 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 
511 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.21 
 
 
517 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.7 
 
 
510 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.47 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.47 
 
 
510 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.52 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.81 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  24.1 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  23.54 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  23.4 
 
 
991 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  26.87 
 
 
547 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 
514 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  24.8 
 
 
583 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 
553 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  22.97 
 
 
981 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 
551 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.74 
 
 
537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 
807 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  22.86 
 
 
1005 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  23.7 
 
 
543 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 
515 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  23.7 
 
 
530 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  23.21 
 
 
1005 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.41 
 
 
510 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  23.21 
 
 
1005 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  25.54 
 
 
544 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  23.05 
 
 
543 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.92 
 
 
583 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
525 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 
517 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  23.6 
 
 
539 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  24.44 
 
 
557 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 
498 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  25.25 
 
 
532 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  23.12 
 
 
632 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0382905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>