More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3021 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  100 
 
 		 292 aa  607  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.34 
 
 		 467 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  26.37 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  29.59 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  27.6 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.68 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  26.84 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  22.95 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  26.37 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  39.1 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  37.6 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  27.37 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  30.13 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  25.7 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  28.08 
 
 		 897 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  25.62 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  23.51 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  25.63 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  23.24 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.78 
 
 		 1010 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.01 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  24.91 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.17 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  26.55 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.26 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  25.53 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  38.02 
 
 		 876 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  27.65 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  24.92 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  28.03 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  28.72 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  25.17 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.24 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.58 
 
 		 968 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  24.92 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  24.48 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  35.04 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  26.54 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  25.88 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  23.96 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  23.97 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  26.92 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  26.04 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  34.07 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  31.16 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.19 
 
 		 642 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.83 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.03 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.69 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  24.65 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.21 
 
 		 866 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  24.6 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  25.95 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  28.68 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  29.93 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.41 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  26.37 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  28.16 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  22.37 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  25.32 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.12 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  31.54 
 
 		 532 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 868 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  25.26 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  23.97 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  29.29 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  34.53 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.1 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  25.41 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  25.77 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.1 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  23.97 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  24.04 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  21.09 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  26.1 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  24.91 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.17 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.75 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  29.66 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  25.69 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  26.05 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  21.67 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  24.22 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.8 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.63 
 
 		 642 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  28.47 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  23.47 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  22.97 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  26.89 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  24.12 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  24.64 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>