157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2015 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  276  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  48.7 
 
 		 315 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  43.9 
 
 		 319 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  41.74 
 
 		 319 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  41.96 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  39.02 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  46.09 
 
 		 305 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  35.34 
 
 		 321 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  39.55 
 
 		 312 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  40.96 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  38.33 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  38.14 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  33.63 
 
 		 311 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  32.74 
 
 		 324 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  38 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  32.74 
 
 		 317 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  34.86 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  31.86 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  31.86 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.47 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.73 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.97 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.63 
 
 		 548 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.63 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  39.02 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30.51 
 
 		 548 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  31.15 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.05 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.63 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  33.9 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.61 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  32.03 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  32.03 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.98 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.03 
 
 		 550 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.04 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.06 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.87 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.07 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  27.97 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  37.36 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  29.52 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.01 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.29 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.42 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.92 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  26.45 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  27.35 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  28.45 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  34.69 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  30.84 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  30.84 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.2 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.32 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.41 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.73 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.25 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30.39 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.2 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  29.79 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.33 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.48 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  27.43 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.65 
 
 		 417 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  29.91 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  27.87 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  30.49 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  31.93 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>