More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.97 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  35.95 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.62 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.95 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.65 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.25 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.12 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.22 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.78 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.1 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.78 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  44.1 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35.18 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.59 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.44 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  31.76 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  34.68 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  28.95 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.75 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.15 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.46 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.66 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  31.86 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.5 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.54 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  36.22 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  35.11 
 
 		 393 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.02 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  32.76 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.11 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  45.81 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  35.81 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.91 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.9 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  31.1 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.27 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  37.39 
 
 		 229 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  43.23 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  31.88 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.78 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.5 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.76 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.21 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  34.18 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.43 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.45 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.19 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.99 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  34.22 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  34.22 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.71 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.06 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>