More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0259 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  772    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  34.12 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  35.11 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  31.52 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  44.44 
 
 		 497 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  30.88 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  31.27 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  31.96 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  34.3 
 
 		 629 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  29.93 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  33.08 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  35.38 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  35.93 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  35.93 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  36 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  35.19 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  34.54 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  34.26 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  28.73 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  29.46 
 
 		 256 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  26.87 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 620 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  28.09 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  28.32 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  26.69 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  26.69 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  28.69 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  27.07 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  32.46 
 
 		 845 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  32.46 
 
 		 845 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 469 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 712 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 449 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 624 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  26.18 
 
 		 443 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  30.67 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 587 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  33.89 
 
 		 497 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  29.02 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 462 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 489 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  30.61 
 
 		 344 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  25.74 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  27 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  26.18 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 589 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 587 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 543 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 763 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 763 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  26.69 
 
 		 451 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 511 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 653 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  27.23 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  28.16 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 448 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  24.9 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  31.8 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  29.73 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  27.88 
 
 		 617 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 454 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  29.61 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 510 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 456 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  29.96 
 
 		 473 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 611 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 763 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  29.61 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  25.5 
 
 		 450 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 639 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 584 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 1022 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.77 
 
 		 613 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  30.77 
 
 		 613 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  25.56 
 
 		 535 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 484 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>