More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0385 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  100 
 
 
368 aa  742    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  68.58 
 
 
372 aa  523  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  38.52 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  47.09 
 
 
290 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  36.74 
 
 
379 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  30.88 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  36.94 
 
 
497 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  27.88 
 
 
395 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  28.21 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  33.73 
 
 
435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  30.06 
 
 
396 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  30.06 
 
 
353 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  30.09 
 
 
629 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  32.73 
 
 
405 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
374 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  28.34 
 
 
407 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  26.81 
 
 
331 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  27.53 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  29.02 
 
 
256 aa  93.2  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
592 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
457 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  25.32 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
500 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
604 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  25.28 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  25.28 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  27.55 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  26.32 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  29.87 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  27.95 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  25.47 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
639 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  25.11 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  26.27 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
639 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
544 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 
965 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
455 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  27.19 
 
 
532 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  28.57 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  25.32 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  30.62 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
590 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  25.1 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  26.38 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  25.89 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  25.42 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
815 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  26.34 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1026 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  25.62 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  31.05 
 
 
551 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
763 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
633 aa  77  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  26.46 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  25 
 
 
595 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  26.24 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.41 
 
 
599 aa  76.6  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  24.59 
 
 
617 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
763 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  23.71 
 
 
612 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
639 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
587 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  25.46 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  26.47 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  27.31 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  26.86 
 
 
993 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  25.57 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  29.86 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  26.86 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
763 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>