More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0626 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  36.82 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 407 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  32.48 
 
 		 371 aa  121  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  34.08 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  32.46 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  30.12 
 
 		 389 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  30.13 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  28.7 
 
 		 395 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  29.55 
 
 		 524 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 435 aa  99.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  31.39 
 
 		 379 aa  99  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 375 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  28.29 
 
 		 368 aa  96.3  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 		 471 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 523 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 388 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  31.28 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  28.14 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 421 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 478 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  31.75 
 
 		 405 aa  88.6  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 495 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 484 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  27.32 
 
 		 542 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 515 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 515 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 515 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 482 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  29.33 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  29.33 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  22.8 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.65 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  22.8 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  28.57 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  28.64 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 815 aa  82.4  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 474 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  27.75 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  28.37 
 
 		 629 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1823  histidine kinase  27.18 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  29.02 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  27.49 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  30.29 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 644 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 423 aa  78.6  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1439  histidine kinase  25.51 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0850045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  22.57 
 
 		 472 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  28.19 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.91 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  27.08 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00510304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  27.73 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  25.24 
 
 		 617 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 436 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 584 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 477 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  26.05 
 
 		 457 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  24.55 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  27.41 
 
 		 473 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23920  histidine kinase  26.77 
 
 		 412 aa  75.1  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000513114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  29.61 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  26.07 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 733 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  27.88 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  26.41 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 917 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  24.41 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.36 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  23.83 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  25.58 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  28.1 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  23.51 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  26.18 
 
 		 584 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  24.06 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 489 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>