More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1823 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1823  histidine kinase  100 
 
 		 319 aa  628  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  45.48 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  45.48 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  39.75 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1439  histidine kinase  34.29 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0850045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  32.59 
 
 		 600 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 608 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  32.4 
 
 		 431 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 433 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  33.05 
 
 		 431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  33.05 
 
 		 431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  33.05 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  30.56 
 
 		 438 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  31.76 
 
 		 431 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  31.76 
 
 		 431 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  30.16 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  30.22 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  30.22 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  31.76 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  31.76 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0191  ATPase domain-containing protein  29.28 
 
 		 510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  30.29 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  30.16 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  30.08 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  32.2 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  31.25 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2231  sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0734871  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  34.38 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  31.33 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  30.64 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  30.04 
 
 		 414 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 905 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 576 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 445 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  30.97 
 
 		 439 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 430 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  30.45 
 
 		 437 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  29.36 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 827 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 431 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 911 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 446 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  29.58 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  32.34 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  27.78 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  29.61 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  27.78 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  28.46 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 478 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 500 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  30.09 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  30.09 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 450 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 453 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  30.34 
 
 		 434 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  28.69 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  30.67 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 608 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  27.78 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  32.37 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 733 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 432 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 432 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28.31 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.7 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  32.6 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>