More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1439 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1439  histidine kinase  100 
 
 		 327 aa  653    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0850045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  36.01 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  36.01 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1823  histidine kinase  34.75 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  33.12 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.77 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  29.33 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  27.93 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  27.98 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.41 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  25.23 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  26.27 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  27.31 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  26.46 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 551 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  29.11 
 
 		 406 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 423 aa  99  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  26.69 
 
 		 392 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 613 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  27.33 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  27.57 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  29.69 
 
 		 422 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.22 
 
 		 461 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0404  histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  31.71 
 
 		 571 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.71 
 
 		 571 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 445 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 446 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  26.89 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  31.1 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  26.42 
 
 		 393 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.42 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  25 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 462 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  25 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  27.16 
 
 		 402 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.47 
 
 		 537 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  25.24 
 
 		 439 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 465 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 608 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  25.24 
 
 		 443 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 517 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 478 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  31.37 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  28.06 
 
 		 480 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  25.79 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  26.4 
 
 		 465 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 443 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 422 aa  93.6  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 411 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  28.1 
 
 		 446 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  24.45 
 
 		 431 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 448 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 448 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  27.54 
 
 		 473 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  30.57 
 
 		 377 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 382 aa  92.8  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 571 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.8 
 
 		 468 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  28.31 
 
 		 401 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 639 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  25 
 
 		 467 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 902 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 433 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 443 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.917759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  24.68 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 495 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.87 
 
 		 895 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 1042 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 639 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 905 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0394  sensor histidine kinase  30 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.372453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 555 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 816 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 889 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 892 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  28.04 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>