More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1774 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  100 
 
 
290 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  48.16 
 
 
372 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  47.09 
 
 
368 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  41.76 
 
 
393 aa  191  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  42.72 
 
 
379 aa  175  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  33.08 
 
 
389 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  35.82 
 
 
497 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  35.44 
 
 
405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  34.33 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  30.19 
 
 
395 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  32.52 
 
 
629 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
375 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  28.44 
 
 
436 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  30.96 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
396 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  28.38 
 
 
443 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
353 aa  99.4  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  29.96 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  27.51 
 
 
430 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  27.51 
 
 
430 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  28 
 
 
436 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
448 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
439 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  29.75 
 
 
449 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  25.89 
 
 
427 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
457 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
454 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  30.84 
 
 
435 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  30.04 
 
 
435 aa  90.5  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  31.28 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.04 
 
 
599 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
454 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
448 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  26.84 
 
 
443 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  22.66 
 
 
392 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
430 aa  89  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
466 aa  89  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  29.39 
 
 
432 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  22.5 
 
 
429 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  28.51 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  25.78 
 
 
412 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
435 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  28.51 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  31.12 
 
 
388 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
470 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
435 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  27.73 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  30.84 
 
 
443 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
436 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  28.51 
 
 
438 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
435 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
437 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
432 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  27.23 
 
 
440 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 
439 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
432 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
432 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  28.18 
 
 
466 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  29.11 
 
 
507 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
432 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
435 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  27.85 
 
 
437 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  28.51 
 
 
438 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  31.58 
 
 
575 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  24.29 
 
 
406 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  24.77 
 
 
535 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  30.26 
 
 
439 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  31.33 
 
 
554 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
554 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  28.44 
 
 
438 aa  85.9  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
495 aa  85.9  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  27.23 
 
 
446 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
500 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  28.44 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  28.64 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  27.15 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.68 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  27.27 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  26.99 
 
 
727 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  26.61 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  22.58 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  23.89 
 
 
422 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  26.64 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  26.64 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  25.42 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>