More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1580 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 497 aa  998    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  38.66 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  38.74 
 
 		 629 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  44.44 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  39.71 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  38.28 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  36.94 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  34.98 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  35.82 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  33.84 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  31.48 
 
 		 395 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  34.72 
 
 		 389 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  30.85 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  33 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 407 aa  97.4  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  31.08 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  27.57 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  29.72 
 
 		 400 aa  93.6  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  28.7 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 609 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  28.51 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 587 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 435 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 435 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  25.42 
 
 		 486 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 384 aa  86.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  27.88 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 608 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.38 
 
 		 993 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.98 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  27.73 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  26.83 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  26.83 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  26.83 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 1741 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  24.91 
 
 		 1111 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  25.55 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.98 
 
 		 923 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  23.2 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  31.11 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3306  sensor histidine kinase  26.16 
 
 		 1171 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  27.11 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  26.14 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 885 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  29.74 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  29.02 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  31.97 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  26.49 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  29.1 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  26.42 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.43 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  26.42 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  28.14 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  28.14 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  28.14 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  28.14 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  28.14 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>