More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1247 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
353 aa  701    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1478  histidine kinase  29.15 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  33.06 
 
 
331 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  25.32 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  29.61 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  28.83 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  28.94 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
457 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  25 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  23.61 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  27.27 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  29.1 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  24 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  26.42 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  25.06 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  27.98 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  32.62 
 
 
481 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  22.34 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  22.34 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  24.89 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  24.57 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
448 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  26.42 
 
 
425 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  31.91 
 
 
502 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  28.8 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  25.22 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  31.37 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  23.48 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  23.08 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  24.49 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  22.34 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.08 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  22.18 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  23.53 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  35.9 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  27.89 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  24.62 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  27.66 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
592 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  22.61 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  28.32 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  28.32 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  28.32 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  23.9 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  28.32 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  29.47 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  26.51 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  24.49 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  36.19 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  25.59 
 
 
527 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  31.58 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
888 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
452 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  37.7 
 
 
491 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  37.7 
 
 
491 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  37.7 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.57 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.91 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  26.04 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  36.19 
 
 
501 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  27.75 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  26.56 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.83 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  36.19 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.84 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  29.57 
 
 
486 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
581 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  39.33 
 
 
524 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  29.44 
 
 
452 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  36.19 
 
 
501 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  28.96 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  29.44 
 
 
452 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>