253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0054 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  57.48 
 
 
337 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  43.11 
 
 
335 aa  258  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  39.81 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  38.08 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  39.63 
 
 
380 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  37.22 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.2 
 
 
348 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  36.07 
 
 
372 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  35.16 
 
 
377 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.64 
 
 
360 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.64 
 
 
360 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  32.1 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  30.17 
 
 
354 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.45 
 
 
355 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.69 
 
 
324 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.9 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  35.63 
 
 
344 aa  152  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  31.36 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  33.22 
 
 
310 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  32.46 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  32.34 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  32.27 
 
 
340 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.28 
 
 
368 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.98 
 
 
340 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  32.05 
 
 
352 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  32.05 
 
 
352 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  31.98 
 
 
340 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.98 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.94 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.98 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.64 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  30.66 
 
 
348 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  31.01 
 
 
362 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  32.56 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.74 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  27.49 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  28.4 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  34.49 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  27.3 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  31.09 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  27.69 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  30.7 
 
 
330 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.87 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.45 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  31.83 
 
 
322 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  31.69 
 
 
311 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  31.63 
 
 
315 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  27.81 
 
 
342 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  27.02 
 
 
331 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  29.18 
 
 
348 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.54 
 
 
337 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  29.24 
 
 
360 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  30.14 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  30.14 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  30.14 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  32.34 
 
 
284 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  29.59 
 
 
360 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.14 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  30.14 
 
 
349 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  30.03 
 
 
364 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  27.71 
 
 
362 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  27.22 
 
 
362 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  27.22 
 
 
362 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  27.22 
 
 
362 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  31.01 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  27.33 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  28.9 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  31.34 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  27.22 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  28.9 
 
 
319 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  31.35 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  28.62 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  28.82 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  31.03 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  29.38 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.62 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  30.27 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  30.65 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  30.27 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  30.92 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  29.89 
 
 
316 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
573 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  28.48 
 
 
411 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  29.37 
 
 
333 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  28.07 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  32.02 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  29.89 
 
 
316 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>