75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4097 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  80.68 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  68.45 
 
 		 207 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  64.56 
 
 		 207 aa  294  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  61.27 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  61.27 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  61.27 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  59.31 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  59.8 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  59.8 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  59.6 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  59.31 
 
 		 206 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  57.35 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  58.33 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  44.33 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  45.45 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  34.34 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  32.84 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  33.67 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  30.61 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  27.89 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  27.32 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  28.87 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  28.5 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  32.32 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  31.71 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  26.63 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  26.63 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  23.47 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  25.73 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  25.39 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  25.76 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  22.89 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  22.39 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  22.61 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  22.4 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  25 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  22.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  23.04 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  21.94 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  22.45 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  24.07 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  28.05 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  21.54 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  21.83 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  21.94 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  20.41 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  20.41 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  22.63 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  20.91 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  21.83 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  21.43 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  25.45 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  20.4 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  21.32 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  36.54 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>