More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6491 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  100 
 
 
355 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  67.71 
 
 
355 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  66.57 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  66.29 
 
 
358 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  62.82 
 
 
355 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.76 
 
 
355 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.24 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.06 
 
 
355 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.77 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.93 
 
 
355 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.96 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.85 
 
 
354 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 
357 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.6 
 
 
357 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
357 aa  342  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
357 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  48.46 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.38 
 
 
357 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.32 
 
 
376 aa  332  6e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.61 
 
 
355 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.56 
 
 
364 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.59 
 
 
355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 
357 aa  326  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.55 
 
 
356 aa  326  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
357 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.76 
 
 
355 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 
356 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.02 
 
 
359 aa  309  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.94 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.2 
 
 
354 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.18 
 
 
344 aa  285  8e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 
358 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.17 
 
 
354 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.97 
 
 
355 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.49 
 
 
351 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
365 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.87 
 
 
320 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.87 
 
 
353 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.14 
 
 
396 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
411 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.04 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
411 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  37.97 
 
 
243 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 
399 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 
293 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  31.52 
 
 
399 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.78 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.52 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1135  dTDP-glucose pyrophosphorylase  38.43 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.12196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
293 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
293 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.22 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.24 
 
 
291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.468388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
401 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  36.4 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.58 
 
 
293 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 
290 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
296 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.36 
 
 
286 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4910  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
291 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.844228  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.84 
 
 
292 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
294 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.02 
 
 
240 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.78 
 
 
312 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
294 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.25 
 
 
302 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
253 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
414 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.3 
 
 
294 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
294 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.49 
 
 
287 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
292 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
292 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.49 
 
 
287 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.84 
 
 
300 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2893  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.1 
 
 
294 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.413887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.87 
 
 
245 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  40.89 
 
 
310 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.72 
 
 
292 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
235 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.1 
 
 
294 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00238421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.78 
 
 
300 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0504  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 
295 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0219924  normal  0.028839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
246 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
294 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 
293 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.87 
 
 
245 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
245 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
294 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
298 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
293 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>