297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4828 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  58.08 
 
 
302 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  36.49 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  33.1 
 
 
281 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.16 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 
293 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.49 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.86 
 
 
315 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.9 
 
 
282 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.36 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.45 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.8 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
292 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.9 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 
289 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
297 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 
293 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.79 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.62 
 
 
288 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
295 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.68 
 
 
284 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.52 
 
 
303 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  34.13 
 
 
289 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.52 
 
 
273 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
294 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
295 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.34 
 
 
288 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
289 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
289 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
294 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
298 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
290 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.51 
 
 
295 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
295 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
295 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.45 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.4 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.45 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.56 
 
 
347 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.57 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  35.65 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  33.79 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.49 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.42 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.49 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.87 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.99 
 
 
277 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
293 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.19 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  32.65 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  35.21 
 
 
393 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.87 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.5 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  32.19 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.35 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
293 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34 
 
 
294 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34 
 
 
294 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.75 
 
 
288 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
275 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 
341 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.34 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.43 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  29.82 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  29.78 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  36.15 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  35.71 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.12 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  30.9 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>