127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0245 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  64.41 
 
 
281 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  66.17 
 
 
274 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  63.73 
 
 
289 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  67.18 
 
 
260 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  66.41 
 
 
260 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  62.69 
 
 
260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  61.78 
 
 
260 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  34.38 
 
 
260 aa  148  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  35.2 
 
 
275 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  32.95 
 
 
332 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  34.66 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  33.86 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.86 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.86 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.86 
 
 
340 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.86 
 
 
340 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 
267 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  35.44 
 
 
339 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  35.02 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  34.6 
 
 
340 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  31.97 
 
 
319 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  31.69 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  33.59 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  31.27 
 
 
257 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  32.73 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
295 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 
265 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 
269 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.69 
 
 
269 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  30.8 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 
258 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 
250 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  30.96 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
263 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  31.89 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  29.72 
 
 
344 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  32.68 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.47 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  33.73 
 
 
275 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  33.07 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  30.5 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  31.01 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  32.27 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  28.14 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
636 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  36.92 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  29.64 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  25.78 
 
 
316 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  29.72 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  32.68 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  34.22 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  28.04 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  30.56 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.67 
 
 
637 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  29.02 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  30.86 
 
 
246 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  28.92 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  24.22 
 
 
306 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  27.73 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  30.27 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  29.43 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  29.46 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  31.09 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  28.3 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  34.97 
 
 
233 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  34.71 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  28.51 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  31.87 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.31 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  29.5 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  28.15 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  32.22 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  28.91 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  26.77 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  27.04 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  27.95 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  28.15 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  28.98 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  28.79 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  31.98 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  30.16 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  29.75 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>