More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0068 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  902    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1963  major facilitator family transporter  51.06 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000192177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1889  major facilitator family transporter  51.06 
 
 		 435 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000253585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  44.57 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  44.57 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  44.57 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.81 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.81 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.81 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.81 
 
 		 428 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.81 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 432 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  31.4 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  28.75 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  29.61 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  28.88 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  28.88 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.1 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.64 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  28.77 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  28.61 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  29.11 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  29.11 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 455 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.1 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  28.57 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.08 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  29.46 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  28.21 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  28.84 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  28.84 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  28.98 
 
 		 430 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  29.22 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  27.78 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  28.34 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  27 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  28.98 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  28.98 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 460 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  29.02 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  26.44 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  28.54 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  25 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  25 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  25 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  25 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  25 
 
 		 441 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  27.05 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  26.54 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  27 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  27 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  26.54 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  26.54 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.3 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.7 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.89 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  26.54 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  26.54 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>