More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1522 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  71.28 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  70.99 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  70.99 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  70.99 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  67 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  41.06 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  39.6 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  39.6 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  37.46 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  36.79 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  36.36 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  30 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.78 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  26.32 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  26.57 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  26.57 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.98 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.52 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  25.9 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  26.97 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.18 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  27.18 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  27.18 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  27.18 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  25.63 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  26.97 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.02 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25.35 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  26.07 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  26.12 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  24.72 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  24.39 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  24.49 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  24.48 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.25 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.04 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  27.56 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  24.41 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  25.27 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  26.62 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.61 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  26.01 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  24.39 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  25.94 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  24.24 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  23.99 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  24.56 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  25.71 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.44 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  23.79 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  26.98 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  25.68 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>