More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0046 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001803  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein D  83.21 
 
 
396 aa  696  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2328  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  75.83 
 
 
393 aa  637  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.231358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0172  polysaccharide biosynthesis protein  85.75 
 
 
396 aa  717  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0251  capsular polysaccharide biosynthesis protein  85.75 
 
 
396 aa  717  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0046  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
393 aa  815  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00667  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  83.97 
 
 
396 aa  701  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0592  polysaccharide biosynthesis protein CapD  74.37 
 
 
401 aa  616  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1587  polysaccharide biosynthesis protein CapD  73.98 
 
 
404 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3097  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  74.49 
 
 
403 aa  607  1e-172  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.876352  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  67.18 
 
 
399 aa  562  1e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2643  polysaccharide biosynthesis protein CapD  66.16 
 
 
395 aa  554  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3985  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.78 
 
 
412 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  26.32 
 
 
649 aa  121  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  25.95 
 
 
635 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.88 
 
 
680 aa  120  5e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.82 
 
 
627 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.99529e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.49 
 
 
641 aa  118  2e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  30.03 
 
 
656 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.39 
 
 
629 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.61 
 
 
638 aa  117  4e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  29.7 
 
 
637 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.88 
 
 
653 aa  114  2e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.06 
 
 
600 aa  114  2e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.41 
 
 
628 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  29.71 
 
 
626 aa  111  2e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.96 
 
 
653 aa  111  2e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.4 
 
 
614 aa  111  2e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.7e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.87 
 
 
646 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0410  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.12 
 
 
478 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.67 
 
 
676 aa  110  4e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
617 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
662 aa  109  8e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.53165e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.78 
 
 
626 aa  109  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.02 
 
 
629 aa  109  8e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.02 
 
 
607 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.3 
 
 
613 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.76 
 
 
627 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.06 
 
 
625 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27 
 
 
642 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.08 
 
 
627 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.76 
 
 
627 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.76 
 
 
627 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.07 
 
 
343 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.78 
 
 
644 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.97 
 
 
614 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.84 
 
 
643 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  27.54 
 
 
621 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.24 
 
 
627 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.08 
 
 
651 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.97 
 
 
628 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.2 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.3 
 
 
646 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29 
 
 
630 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
647 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.44 
 
 
330 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.13 
 
 
646 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.34 
 
 
594 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.08 
 
 
613 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 
646 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.97 
 
 
616 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1769  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.93 
 
 
577 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.25 
 
 
630 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3895  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.05 
 
 
381 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.13 
 
 
646 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.93 
 
 
613 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  28.85 
 
 
625 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.69 
 
 
659 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.2 
 
 
645 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.75 
 
 
611 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.75 
 
 
607 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.43 
 
 
675 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
644 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.63 
 
 
669 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.79 
 
 
605 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.79 
 
 
605 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.35 
 
 
612 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 
615 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.47 
 
 
648 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.58 
 
 
633 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.85 
 
 
670 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0949  general glycosylation pathway protein  26.61 
 
 
597 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.266256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.58 
 
 
642 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.05 
 
 
649 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.3 
 
 
653 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.96 
 
 
664 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14131  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane-associated protein  26.49 
 
 
520 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.44 
 
 
688 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.02 
 
 
647 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.75 
 
 
660 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
603 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  26.04 
 
 
587 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.67 
 
 
652 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.63 
 
 
335 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  5.92797e-09 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.77 
 
 
340 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>