More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2933 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
282 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
268 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
502 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
275 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 
277 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 
263 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.62 
 
 
387 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
290 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
275 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
291 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
291 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
291 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.94 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.63 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
387 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.45 
 
 
387 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
281 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.15 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
309 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.8 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.08 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.25 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 
396 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
346 aa  79  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.45 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2086  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.96 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.94 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  37.4 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  21.05 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  26.95 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.03 
 
 
425 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.8 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.05 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>