More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4169 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  50.28 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  49.72 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  47.93 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  43.95 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  40.91 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  40.91 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  40.91 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  40.62 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  40.62 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  40.91 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  40.28 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 402 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 407 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  40.22 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 410 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 410 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  38.77 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  40.38 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  38.81 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  37.95 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 407 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 376 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  37.88 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 735 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.62 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  34.38 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  32.33 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  31.06 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.38 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  32.05 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.78 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.05 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>