More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2377 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  65.2 
 
 		 272 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  59.78 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  54.21 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  49.82 
 
 		 285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  38.69 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2338  glutamate racemase  40.81 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  37.92 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  38.81 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  37.45 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  42.22 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  42.22 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  38.2 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  41.11 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.47 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  41.35 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  36.23 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1122  glutamate racemase  38.75 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.742297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36.47 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  34.43 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36.84 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  36.03 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3973  glutamate racemase  38.13 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1760  glutamate racemase  36.69 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  35.97 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.45 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.97 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  35.53 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  35.61 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  35.61 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  35.61 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  35.61 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  41.11 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  35.53 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  33.69 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  35.25 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  33.33 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1593  glutamate racemase  36.9 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0287859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2947  glutamate racemase  36.9 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0897  glutamate racemase  37.27 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0195405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  36.47 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  35.64 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4875  glutamate racemase  37.46 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.81 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  33.21 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  35.71 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  34.89 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  33.83 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.85 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  38.67 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  31.79 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  33.92 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  32.47 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  36.03 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  32.99 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  32.69 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  34.32 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  34.11 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  31.75 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  33.57 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  36.56 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  31.75 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  37.27 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  34.3 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  32.73 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  32.62 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  32.37 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  37.26 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  33.46 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.94 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  34.72 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.94 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  36.64 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  33.82 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  36.12 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  29.82 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  34.19 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  39.91 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  34.75 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  33.33 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  33.46 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  36.74 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  35.71 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  32.66 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  34.04 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.62 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  34.24 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.81 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  33.21 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  32.3 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  33.83 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  33.33 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  33.83 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  37.39 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  33.45 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  35.87 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  33.21 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  36.79 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  32.59 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>