121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 486 aa  954    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  52.19 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  45.97 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  49.68 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  49.05 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  50.52 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  45.03 
 
 		 441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  46.82 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  46.82 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  45.13 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  43.22 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  44.79 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  44.82 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  42.16 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  43.55 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  42.23 
 
 		 439 aa  323  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  42.17 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  39.62 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  41.01 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  38.99 
 
 		 445 aa  296  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  39.57 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  31.01 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  31.01 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  30.13 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  31.01 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  36.92 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  37.6 
 
 		 440 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  30.8 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  30.8 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  30.39 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 437 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  30.39 
 
 		 434 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  30.18 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  35.56 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  36.06 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  34.04 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  35.23 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  31.87 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  33.19 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.47 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  28.39 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  29.6 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.82 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  29.77 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  28.87 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28.87 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  29.29 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  28.39 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.61 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.65 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.77 
 
 		 556 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.22 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  29.46 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.14 
 
 		 642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.88 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  33.9 
 
 		 246 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.46 
 
 		 572 aa  94.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.64 
 
 		 504 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.49 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  28.08 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.36 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  34.85 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  28.04 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  24.85 
 
 		 558 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  28.71 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  31.98 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  36.23 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.56 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.16 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.16 
 
 		 478 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.16 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.16 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.16 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.99 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.21 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  25.05 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.9 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  22.06 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  26.81 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.78 
 
 		 761 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  23.72 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.98 
 
 		 378 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>