179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  59.03 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  54.75 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  47.51 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  47.95 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  49.32 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  51.13 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  50.79 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  47.03 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  47.03 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  47.32 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  47.83 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  45.29 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  50 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  48.18 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  46.12 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  67.27 
 
 		 316 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  44.5 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  47.11 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  47.92 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  47.92 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  47.92 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  45.54 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  41.94 
 
 		 203 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  48.4 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  46.4 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  46.93 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  43 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  37.79 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  37.36 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  36.78 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  30.53 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  34.63 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  30.99 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  37.86 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.27 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.1 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  39.39 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  34.58 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  32.11 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  38.78 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  31.82 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  26.47 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  33.98 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  40.22 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  26.47 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.84 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  31.13 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  24.89 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  43.27 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  34.31 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.53 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.33 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  25.88 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  30.05 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.73 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  39.13 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  29.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  33.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  27.84 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  33.67 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  31.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  30.92 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  31.37 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  29.36 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  29.36 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  32.63 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  34.74 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  32.63 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  35.16 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  22.41 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  29.41 
 
 		 342 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  28.44 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  31.13 
 
 		 183 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  33.68 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.38 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  30.77 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  24.16 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  27.84 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  33.68 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  31.52 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  35.23 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  28.28 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  27.55 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  28.44 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  33.68 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>